1832. Antoine, étudiant en médecine, est amoureux d’Angélique, la fille du meunier. Alors que le choléra se propage au village de Saint Césaire et provoque la panique, le jeune homme investit tout son temps à soigner les victimes et à travailler au laboratoire de son oncle afin de trouver un remède contre la « peste bleue ». Au moulin, la belle Angélique, qui se sent délaissée, repousse les avances d’Ignace, un voleur de moutons, mais se laisse séduire par Patrick Dunnagan, un Irlandais soupçonné d’être porteur de la maladie.

Devant les cas qui se multiplient, continuant de faucher des vies innocentes, des habitants fuient les lieux, tandis que d’autres se fient à des charlatans ou se jettent dans l’alcool pour tuer les germes de l’infection. Rongé par la culpabilité après avoir souhaité une punition divine aux paroissiens négligeant de payer leur dîme, le curé Delisle organise des soirées de prières et des neuvaines, et distribue des images de saint Roch, le patron des pestiférés. 

Quand le fléau commence à s’estomper, l’apprenti médecin tente de reconquérir son amoureuse, mais Angélique n’a pas oublié Patrick… Et Ignace rôde encore. Les villageois arriveront-ils à retrouver la quiétude perdue et la foi en un avenir meilleur ? Comme le grain broyé sous les meules, c’est sans nul doute que chacun ressortira transformé par le passage de cette redoutable épidémie…